Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRGP48443 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRGP48443 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRGP48443 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRGP48443 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRGP48443 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRGP48443 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRGP48443 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRGP48443 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRGP48443 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRGP48443 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRGP48443 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRGP48443 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRGP48443 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRGP48443 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRGP48443 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RXRGP48443 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRGP48443 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRGP48443 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRGP48443 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRGP48443 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRGP48443 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRGP48443 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRGP48443 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRGP48443 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRGP48443 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRGP48443 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRGP48443 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRGP48443 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRGP48443 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRGP48443 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RXRGP48443 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RXRGP48443 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RXRGP48443 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RXRGP48443 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RXRGP48443 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RXRGP48443 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RXRGP48443 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RXRGP48443 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RXRGP48443 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RXRGP48443 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RXRGP48443 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RXRGP48443 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RXRGP48443 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RXRGP48443 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RXRGP48443 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RXRGP48443 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RXRGP48443 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RXRGP48443 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RXRGP48443 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RXRGP48443 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RXRGP48443 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RXRGP48443 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms