Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA4P48169 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA4P48169 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms