Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSFMP43897 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSFMP43897 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSFMP43897 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSFMP43897 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSFMP43897 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSFMP43897 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSFMP43897 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSFMP43897 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSFMP43897 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSFMP43897 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSFMP43897 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSFMP43897 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSFMP43897 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSFMP43897 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TSFMP43897 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TSFMP43897 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TSFMP43897 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSFMP43897 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSFMP43897 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSFMP43897 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSFMP43897 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSFMP43897 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSFMP43897 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSFMP43897 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms