Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA1P43355 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA1P43355 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms