Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA2P42262 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA2P42262 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIA2P42262 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms