Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL4AP40617 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms