Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK1P39086 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK1P39086 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK1P39086 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK1P39086 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK1P39086 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK1P39086 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK1P39086 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK1P39086 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms