Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM23P36406 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM23P36406 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM23P36406 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.6 ms