Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN2P35609 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTN2P35609 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms