Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD13P35453 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD13P35453 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD13P35453 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms