Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRM2P31350 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRM2P31350 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRM2P31350 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RRM2P31350 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RRM2P31350 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RRM2P31350 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RRM2P31350 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRM2P31350 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RRM2P31350 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRM2P31350 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRM2P31350 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRM2P31350 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRM2P31350 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms