Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHRNA5P30532 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA5P30532 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA5P30532 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms