Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-FP30511 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-FP30511 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-FP30511 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms