Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINB3P29508 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINB3P29508 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINB3P29508 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms