Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD34P28906 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD34P28906 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD34P28906 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD34P28906 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD34P28906 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CD34P28906 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD34P28906 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD34P28906 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD34P28906 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD34P28906 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD34P28906 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD34P28906 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD34P28906 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD34P28906 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD34P28906 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD34P28906 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD34P28906 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD34P28906 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
CD34P28906 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD34P28906 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CD34P28906 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms