Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRMP28827 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRMP28827 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
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