Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PEX2P28328 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PEX2P28328 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX2P28328 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX2P28328 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX2P28328 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX2P28328 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX2P28328 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX2P28328 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PEX2P28328 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PEX2P28328 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PEX2P28328 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PEX2P28328 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX2P28328 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX2P28328 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX2P28328 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX2P28328 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX2P28328 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX2P28328 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX2P28328 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX2P28328 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX2P28328 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX2P28328 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX2P28328 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms