Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMLP26374 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMLP26374 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMLP26374 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMLP26374 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMLP26374 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMLP26374 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHMLP26374 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMLP26374 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMLP26374 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMLP26374 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMLP26374 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMLP26374 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMLP26374 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMLP26374 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMLP26374 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMLP26374 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMLP26374 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMLP26374 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMLP26374 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMLP26374 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMLP26374 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMLP26374 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMLP26374 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMLP26374 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMLP26374 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMLP26374 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMLP26374 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMLP26374 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMLP26374 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHMLP26374 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMLP26374 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMLP26374 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMLP26374 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMLP26374 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMLP26374 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMLP26374 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMLP26374 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMLP26374 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMLP26374 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMLP26374 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMLP26374 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMLP26374 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMLP26374 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMLP26374 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMLP26374 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMLP26374 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMLP26374 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMLP26374 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMLP26374 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMLP26374 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMLP26374 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMLP26374 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMLP26374 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMLP26374 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMLP26374 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMLP26374 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMLP26374 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMLP26374 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMLP26374 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMLP26374 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMLP26374 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMLP26374 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMLP26374 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMLP26374 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMLP26374 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMLP26374 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMLP26374 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMLP26374 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms