Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GADD45AP24522 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GADD45AP24522 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GADD45AP24522 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms