Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN3P20807 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPN3P20807 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN3P20807 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPN3P20807 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms