Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNA2P20248 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCNA2P20248 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNA2P20248 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNA2P20248 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms