Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCLP19338 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCLP19338 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCLP19338 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCLP19338 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NCLP19338 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCLP19338 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NCLP19338 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCLP19338 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCLP19338 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCLP19338 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCLP19338 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCLP19338 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCLP19338 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCLP19338 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCLP19338 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCLP19338 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCLP19338 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCLP19338 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCLP19338 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCLP19338 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCLP19338 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCLP19338 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCLP19338 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCLP19338 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCLP19338 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCLP19338 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCLP19338 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NCLP19338 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCLP19338 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCLP19338 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCLP19338 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCLP19338 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCLP19338 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCLP19338 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCLP19338 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCLP19338 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCLP19338 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCLP19338 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms