Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XRCC1P18887 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC1P18887 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms