Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DESP17661 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DESP17661 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DESP17661 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DESP17661 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DESP17661 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DESP17661 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DESP17661 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DESP17661 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DESP17661 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DESP17661 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DESP17661 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DESP17661 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DESP17661 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DESP17661 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DESP17661 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DESP17661 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DESP17661 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DESP17661 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DESP17661 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DESP17661 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DESP17661 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DESP17661 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DESP17661 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DESP17661 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DESP17661 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DESP17661 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DESP17661 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DESP17661 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DESP17661 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DESP17661 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DESP17661 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DESP17661 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DESP17661 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DESP17661 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DESP17661 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DESP17661 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DESP17661 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DESP17661 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DESP17661 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DESP17661 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DESP17661 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DESP17661 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DESP17661 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DESP17661 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DESP17661 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms