Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSHRP16473 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSHRP16473 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSHRP16473 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSHRP16473 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSHRP16473 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSHRP16473 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSHRP16473 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSHRP16473 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSHRP16473 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSHRP16473 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSHRP16473 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSHRP16473 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSHRP16473 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSHRP16473 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSHRP16473 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSHRP16473 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSHRP16473 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSHRP16473 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSHRP16473 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSHRP16473 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSHRP16473 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSHRP16473 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSHRP16473 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSHRP16473 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSHRP16473 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSHRP16473 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSHRP16473 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSHRP16473 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSHRP16473 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSHRP16473 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSHRP16473 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSHRP16473 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSHRP16473 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSHRP16473 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSHRP16473 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSHRP16473 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSHRP16473 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSHRP16473 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSHRP16473 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSHRP16473 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSHRP16473 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms