Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM27P14373 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms