Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRAP10827 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRAP10827 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP10827 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP10827 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP10827 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP10827 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP10827 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
THRAP10827 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
THRAP10827 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP10827 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP10827 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP10827 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP10827 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP10827 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP10827 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP10827 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP10827 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP10827 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP10827 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP10827 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP10827 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP10827 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP10827 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP10827 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP10827 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP10827 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP10827 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP10827 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP10827 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP10827 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP10827 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP10827 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP10827 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms