Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TGFB3P10600 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms