Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HKR1P10072 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HKR1P10072 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HKR1P10072 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HKR1P10072 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HKR1P10072 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HKR1P10072 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HKR1P10072 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HKR1P10072 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HKR1P10072 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HKR1P10072 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HKR1P10072 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HKR1P10072 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HKR1P10072 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HKR1P10072 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HKR1P10072 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms