Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC192P0DO97 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC192P0DO97 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms