Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
U2AF1L5P0DN76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
U2AF1L5P0DN76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
U2AF1L5P0DN76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms