Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRSS56P0CW18 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRSS56P0CW18 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms