Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0C879 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0C879 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0C879 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P0C879 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0C879 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0C879 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P0C879 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P0C879 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P0C879 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0C879 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0C879 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0C879 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0C879 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0C879 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0C879 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P0C879 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms