Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC172P0C7W6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms