Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXB7P09629 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXB7P09629 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms