Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRBP09619 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRBP09619 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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