Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI1P08151 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI1P08151 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI1P08151 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLI1P08151 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI1P08151 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI1P08151 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI1P08151 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI1P08151 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI1P08151 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLI1P08151 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI1P08151 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI1P08151 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI1P08151 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI1P08151 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI1P08151 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI1P08151 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI1P08151 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI1P08151 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI1P08151 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI1P08151 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI1P08151 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI1P08151 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI1P08151 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI1P08151 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI1P08151 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI1P08151 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI1P08151 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI1P08151 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI1P08151 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI1P08151 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI1P08151 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI1P08151 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI1P08151 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI1P08151 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms