Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMG1P04279 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMG1P04279 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms