Protein–RNA interactions for Protein: P01763

IGHV3-48, Immunoglobulin heavy variable 3-48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-48P01763 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-48P01763 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms