Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL1O95922 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL1O95922 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL1O95922 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms