Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN12O95859 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN12O95859 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN12O95859 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms