Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNTO95613 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNTO95613 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNTO95613 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PCNTO95613 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PCNTO95613 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCNTO95613 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNTO95613 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNTO95613 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNTO95613 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNTO95613 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNTO95613 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNTO95613 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNTO95613 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNTO95613 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNTO95613 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNTO95613 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNTO95613 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNTO95613 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCNTO95613 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNTO95613 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNTO95613 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNTO95613 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNTO95613 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNTO95613 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNTO95613 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNTO95613 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNTO95613 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCNTO95613 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNTO95613 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNTO95613 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNTO95613 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PCNTO95613 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNTO95613 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCNTO95613 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNTO95613 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNTO95613 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNTO95613 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCNTO95613 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNTO95613 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNTO95613 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNTO95613 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNTO95613 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNTO95613 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNTO95613 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PCNTO95613 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNTO95613 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNTO95613 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNTO95613 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNTO95613 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms