Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAPBO95292 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAPBO95292 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VAPBO95292 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VAPBO95292 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAPBO95292 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAPBO95292 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms