Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN1O94985 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN1O94985 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms