Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFASCO94856 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFASCO94856 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFASCO94856 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFASCO94856 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFASCO94856 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFASCO94856 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFASCO94856 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFASCO94856 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFASCO94856 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFASCO94856 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFASCO94856 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFASCO94856 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NFASCO94856 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFASCO94856 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFASCO94856 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFASCO94856 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFASCO94856 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFASCO94856 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFASCO94856 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFASCO94856 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFASCO94856 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFASCO94856 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFASCO94856 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFASCO94856 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFASCO94856 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFASCO94856 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFASCO94856 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFASCO94856 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFASCO94856 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFASCO94856 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFASCO94856 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFASCO94856 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFASCO94856 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFASCO94856 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms