Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN5O94779 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms