Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT38O76015 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT38O76015 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT38O76015 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT38O76015 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT38O76015 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT38O76015 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT38O76015 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT38O76015 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT38O76015 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT38O76015 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT38O76015 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT38O76015 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT38O76015 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT38O76015 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT38O76015 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT38O76015 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT38O76015 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT38O76015 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT38O76015 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT38O76015 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT38O76015 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT38O76015 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT38O76015 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT38O76015 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT38O76015 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT38O76015 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT38O76015 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT38O76015 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT38O76015 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT38O76015 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT38O76015 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT38O76015 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT38O76015 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT38O76015 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT38O76015 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT38O76015 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT38O76015 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT38O76015 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT38O76015 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT38O76015 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms