Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF9O75901 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF9O75901 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF9O75901 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms