Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPP40O75818 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPP40O75818 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPP40O75818 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPP40O75818 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPP40O75818 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPP40O75818 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPP40O75818 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPP40O75818 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPP40O75818 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPP40O75818 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPP40O75818 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPP40O75818 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPP40O75818 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPP40O75818 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPP40O75818 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPP40O75818 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPP40O75818 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPP40O75818 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPP40O75818 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPP40O75818 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPP40O75818 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPP40O75818 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPP40O75818 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPP40O75818 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPP40O75818 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPP40O75818 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPP40O75818 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPP40O75818 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPP40O75818 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPP40O75818 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPP40O75818 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPP40O75818 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPP40O75818 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPP40O75818 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPP40O75818 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPP40O75818 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPP40O75818 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms