Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB3O75712 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB3O75712 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB3O75712 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB3O75712 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB3O75712 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB3O75712 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB3O75712 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB3O75712 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB3O75712 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB3O75712 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB3O75712 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB3O75712 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB3O75712 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB3O75712 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB3O75712 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB3O75712 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB3O75712 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB3O75712 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB3O75712 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB3O75712 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB3O75712 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB3O75712 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB3O75712 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB3O75712 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB3O75712 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB3O75712 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB3O75712 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB3O75712 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB3O75712 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB3O75712 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB3O75712 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB3O75712 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms